# Biofyzika a chemická fyzika

## Studijní materiály od studentů


### Biochemie, bunka a biologické membrány

- [Typy vazeb v molekulách a kondenzovaných soustavách](/NOFY125/Typy%20vazeb%20v%20molekul%C3%A1ch%20a%20kondenzovan%C3%BDch%20soustav%C3%A1ch%20petrSed.pdf)
- Katěřina Mudroňová: [Biologické membrány](/Biofyzika/Biologické%20membrány%20selekt%20permeabilita%20typy%20transportu.pdf) - Biologické membrány, selektivní permeabilita biologických membrán, typy transportu biologickou membránou.
- [Vznik acetylkoenzýmu A](/Biofyzika/Vznik acetylkoenzymu A.pdf)
- [Přeměna chemické energie na mechanickou](/Biofyzika/Premena%20chemicke%20energie%20v%20mechanickou.pdf)
- [Pentózový cyklus](/Biofyzika/Pentozovy cyklus.pdf)
- [Konformace molekul](/Biofyzika/Konformace molekul Martin.pdf)
- [Složení a struktura základních biomolekul](/Biofyzika/Slozeni zakladnich biomolekul.pdf) - nukleové kyseliny, proteíny, sacharidy
- [Bunka, organely, deleni, signalizace](/Biofyzika/Bunka%20organely%20deleni%20signalizace.pdf)
- [Aerobní odbourávání cukrů (Krebs) + oxid. fosforylace (e-transportní řetězec)](/Biofyzika/Aerobni odbouravani cukru a oxid fosforylace.pdf)
- [Fotosyntéza a dýchaní a fotosyntéza, antény a reak. centra atd.](/Biofyzika/Fotosynteza%20a%20dychani.pdf)

### Experimentální metody

- [Elektrónová a absorbční spektroskopie, vibrační spektroskopie, Ramanova spektroskopie](/Biofyzika/Elektronova a absorbcni spektroskopie Vibr. sp. Raman.pdf)
- [Gyromagnetická částice, jev magnetické rezonance](/Biofyzika/Gyromag castice jev MR.pdf)
- [Jednodimenziální a dvoudimenziální pulzní NMR – koncepce, základní pulsní sekvence.](/Biofyzika/1D%202D%20NMR.pdf)
- [NMR spektroskopie vysokého rozlišení v kapalné a pevné fázi – spinový hamiltonián, typy interakcí, projevy ve spektrech](/Biofyzika/Nmr v kapalne a pevne fazi.pdf)
- [Zobrazovaní magnetickou rezonancí (MR imaging)](/Biofyzika/Zobrazování MR (MR Imaging).pdf)
- [Dekapling, koherentní transfer polarizace, nukleární Overhauserův jev (NMR spektroskopia)](/Biofyzika/Dekapling%20koherentni%20transfer%20polarizacetrans%20nuklearni Overhauseruv%20efekt.pdf)
- [Absorpce, stimulovaná a spontánní emise. Einsteinovy koeficienty.](/Biofyzika/Absorpce stimulovana a spontanni emise Martin.pdf) - poloha spektrálnich čar




### Kvantová teorie molekul a ďalšie kvantové predmety

- [Roothaanovy rovnice](/Biofyzika/Roothaanovy%20rovnice.pdf) - podľa: Skála L., Kvantová teorie molekul, kapitoly 14, 16, 17, 18
- [Hladiny atomů, molekul a pevných látek](/NOFY125/Hladiny atomu molek pev petrSed.pdf)
- [Orbitální a spinový magnetický moment a jejich interakce s vnějším polem](/NOFY076/Orbitalni a spinovy moment interakce s MG a EL polem.pdf)
- [Přehled Ab Initio a semiempirických metod](Biofyzika/Prehled Ab Initio a semiempirickych metod.pdf)
- [Metóda LCAO a metóda valenčných vazeb](/NOFY125/Metoda_LCAO_valenc_vazb.pdf)
- [Hladiny atomů, molekul a pevných látek](/NOFY125/Hladiny atomu molek pev petrSed.pdf)
- [Klasifikace elektronovych hladin](/Biofyzika/Klasifikace elektronových hladin milos.pdf)

## Odkazy na web stránky, učebnice a ďalšie študijné materiály


### Krystalografie, symetrie molekul
- tieto témy sa vyskyytujú v predmetoch ako *Klasická a kvantová štatistická fyzika* a *Rentgenová a elektronová strukturní analýza biomolekul a makromolekul*
-   [Multimediální studijní text z mineralogie](https://is.muni.cz/elportal/estud/prif/ps09/9045979/web/pages/ucebnice.html) - na opakovanie a doplnenie základov
-   [Úvod do krystalografie a strukturní analýzy](https://www.xray.cz/krystalografie/str04c.htm) - na opakovanie a doplnenie základov


## Chémia

### Názvoslovie organickej chémie
 - [E-Chembook](https://www.e-chembook.eu/organicka-chemie) - multimediální učebnice chemie pro gymnáziá, dobré na základy názvoslovia
 - [M. Putala, M. Sališová, T. Vencel: NÁZVOSLOVIE ORGANICKÝCH ZLÚČENÍN](https://fns.uniba.sk/fileadmin/prif/chem/kor/vyuka/Nazvoslovie_org_zl_ed2015.pdf)-Študijný materiál: stručné princípy a riešené príklady z Univerzity Komenského v Bratislave, Prŕodovedeckej fakulty, z katedry Organickej chémie
 - [Laktóny a laktámy](https://www.chemkagymtop.sk/docs/seminar/009.pdf) - základné informácie
 - [VŠCHT e-learning: Názvoslovie](https://e-learning.vscht.cz/echo/organika/nazvoslovi.html)
 - [Anhydridy karboxylových kyselin](https://cs.wikipedia.org/wiki/Anhydridy_karboxylov%C3%BDch_kyselin) - potrebné vedieť vzorce uvedené v časti *Názvosloví*
 - [Sulfonové kyseliny](https://eluc.ikap.cz/verejne/lekce/2431) - potrebné vedieť základné sulfónové kyseliny v Tab.1
-  [M. Canov: web](https://canov.jergym.cz/) - web stránka s názvoslovím a aj reakaciami napr. [nitráciou](https://canov.jergym.cz/arome/zapisy/seninit.htm), odkazmi na knihy a ďalšie študijné materiály.